공간 전사체학은 조직 슬라이드 상에서 세포들의 유전자 발현 패턴을 원래의 3차원적 공간 정보와 함께 측정하는 첨단 기술이다.
핵심 원리 및 적용
- 이는 단순히 세포 종류를 분류하는 것을 넘어, 특정 면역세포들이 조직 내 어디에 위치하며 어떤 주변 환경과 상호작용하는지를 밝혀준다.
- 특히, 림프절이나 종양 미세환경(TME) 내에서 T 림프구, 대식세포 등 각 세포 유형별로 나타나는 고유의 mRNA 발현 프로파일을 공간적으로 매핑한다.
이를 통해 특정 면역항암치료 반응과 관련된 미묘한 세포 간 상호작용이나 염증 반응의 국소화를 추적할 수 있으며, 이는 기존의 단일세포 분석으로는 얻기 어려웠던 맥락 정보를 제공한다. 주요 분석 대상에는 사이토카인 발현 패턴 및 TCR 관련 유전자군이 포함된다.
공간 전사체학 면역학 종양미세환경
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